中國醫科大學口腔系成立于1985年，附屬口腔醫院創建于1987年，1998年成立口腔醫學院。2004年9月集醫療、教學、科研于一體的10層綜合樓建成并投入使用，建筑面積12000平方米，位于沈陽市中心地區的中山廣場北側。醫院設有門診、急診及病房，現代化的內部設施，如中央空調、HIS醫院管理網絡、醫患呼叫系統、層流手術室等配套齊全。醫院目前有12個教研室、9個臨床科室、7個醫技科室及中心實驗室。全院現有教職員工306人，其中，碩、博士占師資總數的88%。門診綜合治療椅108張，病床70張。日門診量600余人次。2004年在原有學科的基礎上，經學校和省衛生廳的批準，先后正式成立了整形外科及整形美容中心、口腔頜面腫瘤治療中心、口腔種植中心、干診科等四個學科。2005年6月成立了急診科，都取得了良好的社會效益和經濟效益。
中國醫科大學附屬口腔醫院是沈陽市、遼寧省乃至東北三省的口腔疑難病癥診療中心。同時還承擔著遼寧省老干部口腔醫療保健任務。遼寧省口腔醫學會、遼寧省牙病防治指導組、沈陽醫師協會口腔專科分會掛靠在我院。2005年醫院首次進入遼寧省衛生廳目標管理達標單位，并被評為“遼寧省衛生系統誠信服務先進單位”。我院被國際“微笑列車”、中華慈善總會確定為“微笑列車唇腭裂矯治項目”定點醫院。從2005年3月起，已診治唇腭裂患者350余人次，為社會做出了較大貢獻，同時也增強了醫務人員的社會責任感。被中華慈善總會評為“中華慈善獎”。我院于2005年1月被批準為沈陽市基本醫療保險定點醫院。一年多來，我院積極創建醫療保險患者的就醫環境，建立健全醫療保險管理制度，獲得沈陽市醫療保險管理工作先進單位。沈陽鐵路醫療保險定點醫院也于2006年12月1日正式開通。
醫院擁有先進的醫療檢查設備，如德國進口根管顯微鏡、牙周內窺鏡系統、數字全景X光機、超聲骨刀、手術顯微鏡、擺動鋸、顳下關節鏡及等離子手術系統等。近三年共開展“三新”項目81項。我院在國內較早開展口腔及頭頸腫瘤的綜合治療、唇腭裂序列治療，復雜頜骨骨折等頜面部重癥創傷的救治及顱頜面畸形整復、正頜外科等，應用顯微外科技術行各類組織缺損的修復及器官再造，在國內較早開展口內進路的髁狀突骨折內固定術，在沈陽市獨家開展根管顯微鏡的應用，機用鎳鈦抗扭力馬達用于根管預備，熱力膠垂直加壓填充系統，開展牙周序列治療SPT、GTR、GBR、牙周微創治療及牙周美容手術，應用牙周超聲綜合治療機、Florida探針牙周自動檢測系統、顯微牙周外科手術器械、牙周內窺鏡系統等進行重度疑難牙周疾病的診治。普遍開展各種精密附著體義齒、全瓷，使用鈦合金、金合金鑄造義齒支架或全口義齒的部分基托，應用超聲骨刀行上頜竇提升術、引導骨再生術等新方法，種植牙的數量和質量不斷提高。應用最新技術矯治各類錯牙合畸形等。2006年，我院被中華口腔醫學會確定為國家臨床執業醫師口腔頜面外科培訓基地。
中國醫科大學口腔醫學院是培養口腔醫學高級人才的搖籃，是口腔臨床醫學博士學位及口腔醫學碩士學位授予權學科單位。現有博士生導師10人，碩士生導師45人。二十年來培養（包括在讀）本科生1150人，碩士457人，博士79人。近五年，獲國家及國務院各部門科研項目7項、國家自然基金項目6項、省、部級基金項目68項、市級基金項目12項，總計93項，在各級專業雜志發表論文501篇。我院有27人分別擔任中華醫學會、中華口腔醫學會專業委員會常務委員、委員、學組成員，84人次在各類學術刊物分別擔任主編、副主編、常務編委、編委。為加強口腔醫學院學科建設，挖掘優秀科技人才和鼓勵青年科技人員的科研創新，2006年開始設立院級青年科研啟動基金，每年資助約4-5項。
2006年4月藥物臨床試驗基地通過國家食品藥品監督管理局藥品認證管理中心實地認證評估，2008年9月正式獲得藥物臨床試驗機構資格。醫院還十分重視學術交往與交流。五年來，特別是近兩年醫院選拔5名技術骨干到北京、上海等國內名牌院校進修學習。我院目前已與美國、日本、韓國等國建立了經常性的學術往來關系。每年請外國專家來院講座10余次。已有70余人到美國、日本等國家深造和訪問。2006年10月，我院成功舉辦了第七屆全國口腔病理學會，包括來自日本、臺灣的多名知名專家進行了精彩的講座。