甘肅中醫學院附屬醫院創建于1991年，是一所中醫特色濃厚，臨床科室齊全，集醫療、教學、科研、預防、保健、康復和急救為一體的三級甲等中醫醫院。2010年、2012年被評為全國醫藥衛生系統先進集體。醫院本部現有編制床位660張，實際開放床位達到1200張（含分院），設置內、外、婦、兒等42個臨床科室或部門，7個醫技科室和36個專病門診。醫院下轄北院、西固醫院、暢家巷社區衛生服務站。北院位于皋蘭縣城，即皋蘭縣中醫醫院，占地18.89畝，可開放床位200多張；西固醫院坐落于蘭州市西固區福利路居民區，占地面積6畝，開放床位150多張；位于蘭州市城關區的暢家巷社區衛生服務站開展名中醫夜間門診。
　　針灸科和中西醫結合臨床為國家中醫藥管理局重點學科建設單位，中西醫結合臨床、中醫骨傷學科為甘肅省教育廳重點學科，中西結合心腎科、中西結合呼吸科為甘肅省衛生廳重點學科。
　　心血管科為國家衛計委臨床重點專科，兒科為國家中醫藥管理局重點專科，針灸科為國家臨床重點專科建設單位，心血管科、骨傷科為國家中醫藥管理局重點專科建設單位，中醫骨傷科、腎病科、針灸科、兒科、腦病科為甘肅省重點中醫藥專科；脾胃病科、中藥炮制及質量控制技術研究中心為甘肅省重點中醫藥專科建設單位；脾胃病科、心血管科、腎病科設有國家二級臨床實驗室。醫院設有甘肅省中醫藥防治慢性病重點實驗室。
　　醫院為甘肅省高等醫學院校臨床教學基地，有博導工作站1個、碩士學位培養點8個、臨床研究室4個、臨床教研室9個。醫院人才隊伍中有甘肅省優秀專家2人、博士生導師8人、碩士生導師46人、省級重點學科帶頭人5人、國家名老中醫和甘肅省名中醫21人，甘肅省第一層次“領軍人才”3人、省衛生廳學科帶頭人5人、衛生系統領軍人才10人，4人入選甘肅省“555”“333”人才庫，5人被評為甘肅省衛生廳中青年學術技術帶頭人。近兩年醫院在科研方面有所突破，獲批國家自然科學基金項目7項、吳階平醫學基金項目7項。
　　醫院擁有全國名老中醫傳承工作室9個、甘肅省名中醫工作站、甘肅省針灸推拿臨床醫學中心、甘肅省針灸臨床研究基地、甘肅省中藥炮制及質控研究技術工程中心、李可中醫藥學術流派甘肅省傳承基地。
　　醫院建成有10萬級的符合國家GPP標準的制劑室，擁有中醫藥特色明顯和療效顯著的中藥院內制劑40多種，可以滿足患者的醫療需求；中醫骨傷非手術療法、中藥療法、針灸、推拿、蠟療、理療、熏蒸、刮痧、拔罐等獨具中醫特色的非藥物療法備受患者青睞。醫院開展的“冬病夏治”穴位貼敷等中醫特色療法受到患者歡迎。